با اعمال مدیریت یکپارچه و نگرش جدید در رقابت‌های پژوهشی و روز دنیا به مدیریت مراکز دانش بنیان پرداخته می شود و لازم است تغییر اساسی در نگرش های قبلی به موضوع دانش بنیان ایجاد شود.

 یک شرکت دانش بنیان نمی تواند و امکان ندارد که به صورت خلق الساعه ایجاد شده و کلیه خدمات و پرسنل و نیروهای یک شرکت چند ده ساله را داشته باشد. ساختار و ریخت شناسی شرکت های دانش بنیان باید مورد تجدید نظر اساسی قرار گیرد. نباید برای هر شرکتی و هر ساختاری از برچسب دانش بنیان استفاده کرد.

ایده ها و دانشی که در یک شرکت به محصولات و خدمات دانش بنیان تبدیل می شوند لازم است از نوآوری و گام ابتکاری و پژوهشی برخوردار باشند و مورد حمایت های جدی برای ورود به فازهای بعدی قرار گیرند. یکی از بزرگ ترین آفت ها و صدمات وارد شده به مقوله دانش بنیان، ایجاد شرکت های سایه و شبح گون و در مواردی حتی جعلی و چسباندن نام دانش بنیان به آن ها برای استفاده از رانت ها و وام ها بوده است.